Kudo Shinichi é um rapaz de 17 anos de idade, detetive colegial que as pessoas chamam de "Sherlock Holmes Moderno". No entanto, uma noite Shinichi testemunhou um comércio ilegal e, pego de surpresa, ficou inconsciente e recebeu uma droga que era para matá-lo... mas que teve outro efeito. A fim de rastrear os homens que fizeram isso com ele, Shinichi escondeu sua identidade e passou a morar com Ran, sua amiga de infância, cujo pai é um detetive desanimado.